1.机构设置
特别行政区的行政机关即为特别行政区政府，行政区行政长官是特别行政区政府的首长。特别行政区政府设司、局、厅、处、署等机构。
2.行政官员的任职条件
特别行政区政府的主要官员由在特别行政区通常连续居住满l5年的特别行政区永久性居民中的中国公民担任。
3.特别行政区的行政机关行使的职权
（1）制定并执行政策；
（2）管理各项行政事务；
（3）办理中央政府授权的对外事务；
（4）编制并提出财政预算、决算；拟定并提出法案、议案、附属法规；
（5）委派官员列席立法会，并代表行政机关发言。
4.特别行政区行政机关对立法会负责的表现
（1）行政机关执行立法会通过并已生效的法律；
（2）定期向立法会会议作施政报告；
（3）答复立法会议员的质询；
（4）征税和公共开支必须经立法会批准。