注释，也作“附注”。注释用序号排列。正文中序号标于注释项后边右上角。注释内容按序号附于页脚或文后。页脚下注释，可省略“注释”或“附注”的字样，每页单独排序。文后注释，“注释”或“附注”的字样可用也可不用。
注释主要有两类：
1.引文注释
这是最常见的注释类型，其功能是注明论文引文资料的出处。
不同出版机构和学术期刊引文注释的编写格式或略有差异，但其基本内容大致相同。若引用著作，一般应包括：责任者与责任方式、文献题名、出版地名、出版者、出版时间和引文页码这六要素。例如：
洪子诚《当代诗歌的“边缘化”问题》的一处引文和引文注释：
论文正文：
在80年代，“由于时间差——意识形态解体和商业化浪潮到来前的空白”，“诗人戴错了面具：救世主、斗士、牧师、歌星”④。
引文注释：
④北岛：《失败之书》，汕头：汕头大学出版社，2004年，第168页。
此论文的文后注释④，说明了正文中引号里的直接引语的来源。
若系引用期刊论文，注释内容则应包括：责任者、文献题名、期刊名、年期（或卷期〉、有的还要求注（教材错为“证”）明论文所刊的页码。例如：
贾平凹：《一封荒唐信》，《文学评论》1985年第5期。
上述引文注释格式是目前国内人文社科期刊和著作中较通行的范例。网上有《综合性人文社会科学学术期刊文献注释技术规范》可下载参考。
2.补充注释
有一些需要补充说明的内容，由于正文不便容纳，便在注释中记述。例如：洪子诚《当代诗歌的“边缘化”问题》中一处补充注释：
论文正文：
诗集出版的艰难，诗作稿酬的微薄人所共知②。
补充注释：
②例子之一是，笔者和程光炸编选的诗歌选集，出版社付给诗人的稿酬是每行一元。
此注释是补充说明的例证，为读者深入理解论文，如将其写入正文，会影响行文的简洁流畅，因此放进注释。
又如，程千帆《张若虚〈春江花月夜〉的被理解和被误解》中一处补充注释：
论文正文：
《旧唐书。文苑传上》云：“杨炯与王勃、卢照邻、骆宾王以文词齐名，海内称为王、杨、卢、骆，亦号四杰。”这一记载说明四杰是初唐代表着当时风会的、也被后人公认的一个流派。⑥
补充注释：
⑥闻一多《四杰》一文（载《唐诗杂论》，《闻一多全集》第三册〉认为王、杨长于五律，而卢、骆长于歌行。因此四杰应当分为两组，是不对的。刘开扬《论初唐四杰及其诗》已加辨证，我们同意刘先生的意见。
此注释补充说明文中论点背后隐含的问题：学术歧见和作者立场。